צומת חשוב בנגב הדרומי. דרכי הצומת מוליכות לבאר-שבע, לאבו-עגילה, לאל-עריש, לרפיח ולאילת.
במאי 1948 תפסו המצרים את עוג'ה, והיא נכבשה על-ידי צה"ל במבצע "חורב" (דצמבר 1949), ומכאן חדר צה"ל לסיני.
הסכם שביתת-הנשק הוכרז שאזור ניצנה יהיה מפורז (ללא ביצורים וללא צבא). כאן נקבע מקום המושב של ועדת שביתת-הנשק הישראלית-מצרית. הוקם מחנה משותף ליחידה ישראלית ומצרית, שהיה שבועיים בשליטת המפקד הישראלי ושבועיים – בידי המצרי. כתגובה על פעולות הפידאיון ביטלה ישראל את הפירוז של עוג'ה. בנובמבר 1955 התחולל באזור קרב, והגדוד המצרי נהדף בקרב לילי. באוגוסט 1968 הוקם בניצנה בסיס אימונים של הגדנ"ע.
כיום נמצא בניצנה כפר נוער לנוער יהודי מהתפוצות ואולפן עברית.