בין מלך צרפת "פיליפ היפה" (1285 – 1314) לבין האפיפיור התפתח סכסוך.

פיליפ היפה הטיל מסים על אנשי הכנסייה בצרפת בלי אישור האפיפיור. האפיפיור מצִדו פרסם ב- 1302 הוראה מיוחדת ובה אסר על אנשי הכנסייה לשלם מסים למלך בלי אישורו. בתגובה, החליטה אסיפת המעמדות, שכינס פיליפ היפה באופן חד-פעמי, להדיח את האפיפיור (1302). על כך הגיב האפיפיור בהטלת חרם על המלך. המצב התדרדר, ושליחי המלך חדרו לטירתו של האפיפיור ברומא ואסרו אותו באשמת שחיתות, רצח וניאוף.
בחסות פיליפ היפה נבחר לתפקיד האפיפיור בישוף צרפתי, והוא נאלץ לשבת באוויניון שבדרום צרפת ולא ברומא. מאותה תקופה ישבו האפיפיורים במשך 70 שנה באוויניון, והיו נתונים להשפעת מלכי צרפת (1309- 1378). תקופה זאת, המסמלת את ירידת כוחם של האפיפיור והכנסייה ואת עליית כוחם של המלך והמדינה, כונתה "גלות בבל של האפיפיור".