במחצית שנת 1965 הסעירו את המדינה שני מאורעות: הפילוג במפא"י והידיעה המרה על גזר דין מוות לאלי כהן הי"ד, ישראלי שהיה בשליחות המודיעין הישראלי בסוריה.

* במאי נתלה בדמשק בכיכר המרכזית אלי כהן הי"ד, שהואשם על-ידי הסורים בריגול. אלי כהן פעל בסוריה ארבע שנים במסווה של אזרח סורי אמיד בשם כאמל אמין טאבת, עד שנחשף ונשפט לגזר דין מוות. ישראל ניסתה למנוע את תלייתו, אך ללא הצלחה. עד היום מנהלת ישראל מו"מ להעלאת עצמותיו לישראל.
* האירוע של פילוג מפא"י הסעיר תושבים רבים. מפא"י הייתה המפלגה הגדולה, ובראש המצדדים בפילוג עמד דוד בן-גוריון, שתבע מיורשו לוי אשכול לערוך בירור נוקב בפרשת "העסק הביש". באותה שנה נפל דבר בוועידת מפא"י, והמפלגה התפלגה. בסוף יוני הודיע בן-גוריון על פרישתו מהמפלגה ועל הקמת מפלגה חדשה בשם רפ"י (רשימת פועלי ישראל).
* בבחירות לכנסת ה-6, ב-2 בנובמבר 1965, זכתה מפא"י בראשות אשכול ב-45 מנדטים, ואילו רפ"י עם בן-גוריון, פרס, אלמוגי, נבון ואישים נוספים זכו ב10- מנדטים.

אירועים נוספים בשנה זו:
* ב-30 בנובמבר נבחר טדי קולק לראשות עיריית ירושלים. קולק רץ לבחירות בראש רשימת רפ"י. כשנה וחצי לאחר בחירתו פרצה מלחמת ששת הימים ושני חלקי העיר אוחדו. טדי קולק הפך את ירושלים מעיר צנועה לאחת הערים היפות, המיוחדות והגדולות בעולם. טדי קולק שימש בתפקידו עד ה-2 בנובמבר 1993, מועד הבחירות בהן ניצח אהוד אולמרט.
* אירוע שהסעיר רגשות בארץ היה כינון יחסים דיפלומטיים עם ממשלת גרמניה. ראש הממשלה לוי אשכול תמך בכינון היחסים, ואילו מנהיג תנועת חרות מנחם בגין, מחה נמרצות נגד צעד זה, וטען כי אין מחילה לפשעי הגרמנים. בעקבות כינון היחסים ניתקו מדינות ערב את היחסים הדיפלומטיים עם גרמניה.
* באותה שנה הוקם המגדל הגבוה ביותר בארץ מגדל שלום עם 36 קומות, שנבנה על חורבות גימנסיה הרצליה.
* ב-10 במאי נחנך מוזיאון ישראל, המשכן הלאומי לתרבות ולאומנות.